لقد جاء هذا الأطلس في ستة أبواب رئيسة: تناول الباب الأول قيام الدولة، وتناول الباب الثاني: العصر العباسي الأول، وتناول الباب الثالث: عصر النفوذ التركي، وتناول الباب الرابع: عصر النفوذ البويهي، وتناول الباب الخامس: عصر النفوذ التركي السلجوقي الذي تخلله مجيء الحملات الصليبية على المشرق الإسلامي، وسقوط الدولة العباسية على أيدي المغول سنة 656 هـ. بينما جاء الباب السادس ليتناول أبرز الملامح الحضارية في العصر العباسي. ثم ألحقنا هذه الأبواب بملاحق لإثبات المصادر والمراجع، وفهرس للعناوين والأبواب الخاصة بهذا الأطلس.